■　水生生物情報データベース
水生生物について種の生活を総合的に把握できるように、種の分類情報、生物情報、文献情報、遺伝子情報等が記載されています。また、このデータベースはボランティアデータベースとして運営されますので、情報をお持ちの方は登録も可能です。

■　水産海洋データベース
中央水産研究所は、独立行政法人科学技術振興機構の研究情報データベース化事業の一環として、20世紀の初めから現在にいたる日本周辺海域の海洋環境、卵・稚仔・プランクトン、魚類等に係る調査資料をデータベース化しました。

■　A-line Database
北海道区水産研究所亜寒帯海洋環境部が中心となって、１９８８年より年６回観測を続けてきた北海道厚岸沖の親潮を横切る定線（A-line）の観測データセットを紹介しています。
・水温、塩分は１９８９年〜
・クロロフィル、栄養塩、動物プランクトンは１９９０年〜
・その他、測点図、時系列図、船舶情報など

■　栄養塩・クロロフィルデータベース
中央水産研究所が中心となって、水産研究所観測船が収集した二酸化炭素吸収に関与する植物プランクトンに関連する栄養塩とクロロフィル量、水温、塩分データなどを紹介しています。

■　わが国周辺の水産資源の現状を知るために
我が国周辺水域に分布している主要な水産資源の概ね４０種（例えば，漁獲可能量（ＴＡＣ）制度対象種であるマアジ，マイワシ，マサバ，ゴマサバ，サンマ，スケトウダラ，ズワイガニ，スルメイカなど）の約８０系群（同じ種類でも産卵場，分布，回遊等を異にする地域集団）を紹介しています。

■　国際漁業資源の持続的な利用と適切な保存・管理のために
鯨類や各種漁業による混獲生物及び公海や外国排他的経済水域において漁獲される高度回遊性魚類（かつお・まぐろ類）、溯河性魚類（さけ・ます類）等の国際漁業資源について紹介しています。

■　PICES北太平洋の海洋科学に関する機関
北太平洋温帯及び亜寒帯とこれらに接続する海域における海洋及び生物資源に関する科学的情報や資料の収集と交換を促進することを目的としています。

■　大型クラゲ関連情報
日本海区水産研究所が中心となって、大型クラゲに関する最新情報や、報告を紹介しています。

■　日本海海洋環境部のページ
日本海区水産研究所海洋環境部による、日本海NOAA画像・日本海海況速報等の情報を紹介しています。

■　Off Tohoku Temperature Field
東北区水産研究所が、東北海区水温図について、水産試験場など各県の水産関係機関、ならびに海洋関係４官庁（気象庁、海上保安庁、海上自衛隊、水産庁)をはじめとする関係機関の協力により集められた海洋観測データを元に描いています。

■　東北海区海況情報
東北区水産研究所が、２ヶ月毎に定期的に東北海区の今後の見通し、経過、現況を東北海区海況情報としてお知らせしています。この海況情報は、東北ブロック5県（青森県,岩手県,宮城県,福島県, 茨城県）の水産試験場など水産関係機関をはじめとする 諸関係機関の協力によって、作成されております。

■　東シナ海・黄海のさかな
西海区水産研究所が、１９８６年に発行いたしました東シナ海・黄海のさかなの中から代表的なさかな７２種を抜粋しホームページ版を作成いたしました。

■　長崎近海水温速報
西海区水産研究所が、五島灘に面する長崎県野母崎町地先に水温計を設置し、連続観測を進めています。この水温データを原則として毎週１回、このホームページ上でお伝えします。

■　有明海貧酸素水塊広域連続観測情報
西海区水産研究所が、有明海奥部の海域の生態系に悪影響を及ぼす貧酸素水塊の発生状況把握、発生機構解明及び、発生予察を目的として観測し、有明海奥部に設置した自動観測装置からの観測データを収集して公表しています。

■　水産物の利用・加工
中央水産研究所が、消費者ニーズに応じた水産物の供給や水産物の栄養特性等についての情報を提供し、魚食の普及と水産物消費の拡大を図るために水産物の利用・加工分野の研究成果を紹介しています。

■　リアルタイム海洋情報収集システム
中央水産研究所が、太平洋沿岸を中心とした数カ所の海域で収集した海洋情報を、リアルタイムで提供しています。

■　西部北太平洋に分布する魚類の耳石による種類同定法
遠洋水産研究所が、西部北太平洋に分布する魚類主要１１６種の耳石による種類同定法を提供しています。

■　資源選択性の統計解析
遠洋水産研究所が、動物の生息環境保全、生態系の構造解明、漁獲効率の向上と混獲の回避などの問題にも関連する資源選択性を解析する統計的な手法について紹介しています。

■　N-line Database
北海道区水産研究所が2000〜2007年に行ったオホーツク海の海洋観測データベースです。

■　漁港波浪データベース
水産工学研究所が全国各地の漁港で長期間にわたり観測された波浪データ（一次処理データ）を収集し、とりまとめたものです。
各観測機関からご提供して頂いた一次処理データをそのまま公開しています。
【注意】ＵＲＬが変更されましたので、リンクされている方はリンク先変更をお願いいたします。
　　　　　　（旧ＵＲＬ　：　http://dell120.nrife.affrc.go.jp/wavedb/index.html）

■　海況予測システム(FRA-JCOPE)
水産生物の資源管理の推進と資源変動要因の解明のための基盤情報として，我が国周辺太平洋域における海洋の現況図と２ヶ月先までの予測図を提供します。
水産関係試験研究機関(都道府県水産試験研究機関や水産総合研究センター等の研究者には，別途利用者申請手続きにより研究情報を提供致します。

■　東北ブロック沿岸水温速報
東北区水産研究所が、東北ブロック5県（青森県、岩手県、宮城県、福島県、茨城県）、秋田県、山形県における関係機関の協力を得て、自動観測ブイ及び定地観測による沿岸水温をリアルタイムで提供しています。（携帯サイトあり）